Научно-исследовательская работа была и остается одним из приоритетных направлений деятельности нашего учебного заведения со дня его основания.

Научная работа в университете выполняется за счет средств государственного бюджета, хоздоговоров и грантов.

С октября 2002 университет включен в Государственный реестр научных учреждений, которым предоставляется поддержка государства.

Научную деятельность проводят научные коллективы кафедр и отдельные научные подразделения: Научно-исследовательский институт проблем моделирования многосвязных систем, 17 научно-исследовательских лабораторий (НИЛ), 6 научно-учебных центров.

С первых дней своего существования наше учебное заведение зарекомендовал себя как центр науки и образования в Винницком регионе, генератором научных и технических идей и изобретений, разработчиком новых образовательных технологий.

В разные годы руководство выполнением научно-исследовательских работ на уровне учебного заведения осуществляли также проректоры: Ткаченко С.И., Осадчук В.С. и Юхимчук С.В., Грабко В.В